Mutation AnalysisWe designed primers with the Primer 3 program to ampl的简体中文翻译

Mutation AnalysisWe designed primer

Mutation AnalysisWe designed primers with the Primer 3 program to amplify the full region spanned from the 50 UTR region to exon 3. This span starts from 1.5 kb upstream of exon 1a to 62 bp downstream from exon3. We also amplified all coding regions from exon 4 to exon 9, including splice sites, and the selected regions from intron 3 and 30 UTR. For PCR reactions, the AmpliTaq Gold DNA polymerase(Applied Biosystems, Foster City, CA) or Fast Taq polymerase(Roche,Indianapolis, IN) was used according to manufacturer’s instructions. Both patient and healthy-control genomic-DNA samples served as templates for PCR amplifications. Each PCR product of probands and controls was screened by heteroduplex analysis with the use of denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC WAVE, Transgenomic)26,27 or directly sequenced with the use of ABI 3700 capillary automated-sequencing system (Applied Biosystems, Foster City, CA).Suspected variants were subjected to PCR at least twice and confirmed by digestionor sequences of parents.
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变异分析<br>我们使用引物3程序设计了引物,以扩增从50 UTR区域到外显子3的整个区域。该跨度从外显子1a的1.5 kb上游到外显子3的下游62 bp开始。我们还扩增了从外显子4到外显子9的所有编码区域,包括剪接位点,以及从内含子3和30 UTR选择的区域。对于PCR反应,根据制造商的说明使用AmpliTaq Gold DNA聚合酶(Applied Biosystems,加利福尼亚州Foster市)或Fast Taq聚合酶(Roche,印第安纳州印第安纳州)。患者和健康对照基因组DNA样品均用作PCR扩增的模板。先证者和对照的每种PCR产物均使用变性高效液相色谱法(DHPLC WAVE,Transgenomic)通过异源双链分析进行筛选26,
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突变分析<br>我们设计了入门3程序,将整个区域从 50 UTR 区域扩展至 exon 3。此跨度从 exon 1a 的上游 1.5 kb 开始,从 exon3 向下游的 62 bp。我们还放大了从 exon 4 到 exon 9 的所有编码区域,包括拼接位点,以及 intron 3 和 30 UTR 的选定区域。对于PCR反应,根据制造商的说明,使用安普利塔克金DNA聚合酶(应用生物系统,福斯特市,加利福尼亚州)或快速塔克聚合酶(罗氏,印第安纳波利斯,IN)。患者和健康控制基因组-DNA样本都作为PCR扩增的模板。通过异双面分析筛选出每个PCR产品,使用变性高性能液相色谱(DHPLC WAVE,跨基因组)26,27,或使用ABI 3700毛细管自动测序系统(应用生物系统,加利福尼亚州福斯特市)直接测序。怀疑的变异至少受到PCR两次,并通过父母消化器序列证实。
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突变分析<br>我们用引物3程序设计引物,扩增从50utr区到外显子3的全区。这个跨度从1a号外显子上游的1.5kb到3号外显子下游的62bp。我们还扩增了从第4外显子到第9外显子的所有编码区域,包括剪接位点,以及从内含子3和30 UTR中选择的区域。对于PCR反应,根据制造商的说明使用AmpliTaq Gold DNA聚合酶(加利福尼亚州福斯特市应用生物系统公司)或Fast Taq聚合酶(印第安纳波利斯州罗氏公司)。患者和健康对照组的基因组DNA样本都用作PCR扩增的模板。先证者和对照者的每个PCR产物均通过异源双链分析进行筛选,使用变性高效液相色谱(DHPLC波,跨基因组)26、27或直接序列分析,使用ABI 3700毛细管自动测序系统(应用生物系统,福斯特城,可疑的变异至少接受两次PCR,并由父母的消化序列证实。
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